Theo quyết định công bố, Khu bảo tồn biển Lý Sơn được thực hiện trên phạm vi 7.925ha, trong đó diện tích mặt nước biển 7.113ha. Khu bảo tồn biển Lý Sơn được phân chia thành 3 vùng chức năng gồm: Vùng bảo vệ nghiêm ngặt bảo vệ hệ sinh thái vùng triều, cỏ biển và rạn san hô độ sâu từ 3 đến 20m; Vùng phục hồi sinh thái thuộc khu vực đảo Lớn và đảo Bé trên diện tích gần 2.000ha bảo vệ các loài sinh vật biển; Vùng phát triển trên diện tích 4.500ha gồm âu cảng và phần biển bao quanh. Vành đai bảo vệ Khu bảo tồn được xác lập trên 2.500ha xung quanh để đảm bảo an toàn trong quá trình bảo tồn biển. Các hoạt động bảo vệ môi trường, ngăn chặn khai thác nguồn lợi sinh vật trái phép; phục hồi hệ sinh thái, tái tạo nguồn lợi; nghiên cứu thăm dò khảo sát, khảo cổ; phát triển hình thái du lịch cộng đồng sẽ được triển khai trong chương trình bảo tồn biển.
Mục tiêu của dự án nhằm duy trì, bảo vệ tài nguyên biển, bảo vệ đa dạng sinh học, bảo vệ nơi quần cư của các loài sinh vật, bảo vệ môi trường, tạo điều kiện thuận lợi để phát triển kinh tế và du lịch sinh thái, quản lý và sử dụng bền vững nguồn lợi hải sản. Tổng kinh phí đầu tư cho khu bảo tồn biển Lý Sơn giai đoạn 2015- 2020 là 33,8 tỷ đồng.
Với quyết định thành lập Khu bảo tồn nói trên, du khách đang tiếp tục kỳ vọng về sự phát triển mới của đảo này.
Đảo Lý Sơn là huyện đảo duy nhất của Quảng Ngãi, nằm về phía Đông Bắc, cách đất liền 15 hải lý. Huyện đảo Lý Sơn gồm 3 hòn đảo là Đảo Lớn, Đảo Bé và hòn Mù Cu. Đảo Lớn còn gọi là Cù Lao Ré, là trung tâm của Lý Sơn. Đảo Bé còn có tên gọi khác là An Bình. Hòn Mù Cu ở phía đông, nằm sát Đảo Lớn, là đảo nhỏ nhất và không có người ở. Vài năm trở lại đây, đảo Lý Sơn đã nhận được sự quan tâm của du khách trong và ngoài nước tìm về nơi này để tận hưởng không gian hoang sơ, chưa bị con người tác động nhiều vào thiên nhiên. Có khá nhiều lựa chọn về thời gian để du khách đến đây. Bạn có thể đến Lý Sơn vào mùa hè, trong khoảng từ tháng 6 đến tháng 9 thời tiết khá đẹp và có nắng, phù hợp cho việc đi biển; Nếu bạn muốn mua được sản vật của đảo này, có thể đến vào mùa tỏi. Ở Lý Sơn tỏi bắt đầu được trồng vào tháng 9 và thu hoạch vào khoảng đầu tháng 12; Nếu muốn chọn cho mình chuyến đi đầu năm, bạn có thể đến Lý Sơn vào dịp Lễ khao thề lính Hoàng Sa diễn ra vào các ngày 18-19-20 tháng 3 (âm lịch). Để thu hút du khách và tạo sự hấp dẫn riêng có cho du lịch tại đây, nhà chức năng đã xây dựng nhiều hoạt động thuận lợi cho du khách. Theo đó, từ tháng 11/2016, hành khách đi Lý Sơn có thể mua vé trả tiền trước qua tài khoản.
